MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013205	GC	3	6	100822	100827	0 %	0 %	50 %	50 %	258510099
2003	NC_013205	CCGGC	2	10	100864	100873	0 %	0 %	40 %	60 %	258510099
2004	NC_013205	ACG	2	6	100955	100960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510099
2005	NC_013205	GAG	2	6	101213	101218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510100
2006	NC_013205	GCC	2	6	101219	101224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510100
2007	NC_013205	TGC	2	6	101349	101354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510100
2008	NC_013205	CGA	2	6	101407	101412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510100
2009	NC_013205	GC	4	8	101440	101447	0 %	0 %	50 %	50 %	258510100
2010	NC_013205	AGG	2	6	101493	101498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510100
2011	NC_013205	CGG	2	6	101514	101519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510100
2012	NC_013205	GC	4	8	101522	101529	0 %	0 %	50 %	50 %	258510100
2013	NC_013205	GCC	2	6	101549	101554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510100
2014	NC_013205	GC	3	6	101570	101575	0 %	0 %	50 %	50 %	258510100
2015	NC_013205	GCG	2	6	101586	101591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510100
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2017	NC_013205	TCG	2	6	101628	101633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510100
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2019	NC_013205	GGCGAG	2	12	101762	101773	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258510100
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2021	NC_013205	GAT	2	6	101883	101888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510101
2022	NC_013205	GCC	2	6	101896	101901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510101
2023	NC_013205	TCG	2	6	102053	102058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510101
2024	NC_013205	GAG	2	6	102066	102071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510101
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2034	NC_013205	TCGC	2	8	102610	102617	0 %	25 %	25 %	50 %	258510101
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2042	NC_013205	CGA	2	6	102962	102967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510101
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2052	NC_013205	GCC	2	6	103324	103329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510101
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2054	NC_013205	GCG	2	6	103361	103366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510101
2055	NC_013205	TCGC	2	8	103372	103379	0 %	25 %	25 %	50 %	258510101
2056	NC_013205	GCG	2	6	103382	103387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510101
2057	NC_013205	GGCG	2	8	103422	103429	0 %	0 %	75 %	25 %	258510101
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2105	NC_013205	GC	3	6	105049	105054	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2106	NC_013205	CG	3	6	105091	105096	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
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2117	NC_013205	CAAGCG	2	12	105610	105621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
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2120	NC_013205	CGCTT	2	10	105720	105729	0 %	40 %	20 %	40 %	258510102
2121	NC_013205	CGG	2	6	105738	105743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2122	NC_013205	GGC	2	6	105769	105774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2123	NC_013205	CCG	2	6	105782	105787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2124	NC_013205	GGA	2	6	105802	105807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510102
2125	NC_013205	GCC	2	6	105822	105827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
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2127	NC_013205	GC	3	6	105921	105926	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
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2129	NC_013205	ACT	2	6	105960	105965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510102
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2132	NC_013205	CG	3	6	106161	106166	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2133	NC_013205	GC	3	6	106212	106217	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2134	NC_013205	GCA	2	6	106249	106254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
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2136	NC_013205	CG	3	6	106267	106272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
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2143	NC_013205	GCGAG	2	10	106581	106590	20 %	0 %	60 %	20 %	258510102
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2229	NC_013205	GGAT	2	8	110254	110261	25 %	25 %	50 %	0 %	258510107
2230	NC_013205	TCA	2	6	110279	110284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510107
2231	NC_013205	CGGCG	2	10	110286	110295	0 %	0 %	60 %	40 %	258510107
2232	NC_013205	CCGA	2	8	110456	110463	25 %	0 %	25 %	50 %	258510108
2233	NC_013205	CGAGCG	2	12	110502	110513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510108
2234	NC_013205	GTC	2	6	110521	110526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510108
2235	NC_013205	GCG	3	9	110562	110570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510108
2236	NC_013205	CGGC	2	8	110590	110597	0 %	0 %	50 %	50 %	258510108
2237	NC_013205	TCCA	2	8	110608	110615	25 %	25 %	0 %	50 %	258510108
2238	NC_013205	GAC	2	6	110659	110664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510108
2239	NC_013205	GCG	2	6	110669	110674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510108
2240	NC_013205	GGA	2	6	110694	110699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510108
2241	NC_013205	AGC	2	6	110944	110949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510109
2242	NC_013205	GAGCCG	2	12	110997	111008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510109
2243	NC_013205	GAAATT	2	12	111015	111026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	258510109
2244	NC_013205	CCGCG	2	10	111350	111359	0 %	0 %	40 %	60 %	258510110
2245	NC_013205	CAC	2	6	111401	111406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510110
2246	NC_013205	CAG	2	6	111416	111421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
2247	NC_013205	GAC	2	6	111437	111442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
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2249	NC_013205	CGG	2	6	111556	111561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
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2253	NC_013205	GGC	2	6	111725	111730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
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2342	NC_013205	CCA	2	6	115101	115106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510113
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2344	NC_013205	CGA	2	6	115420	115425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510114
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2359	NC_013205	GC	3	6	116256	116261	0 %	0 %	50 %	50 %	258510114
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2362	NC_013205	GGAC	2	8	116704	116711	25 %	0 %	50 %	25 %	258510115
2363	NC_013205	CGC	2	6	116717	116722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510115
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2365	NC_013205	CGGA	2	8	116788	116795	25 %	0 %	50 %	25 %	258510115
2366	NC_013205	CGT	2	6	116798	116803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510115
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2486	NC_013205	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510122
2487	NC_013205	GAG	2	6	122219	122224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510122
2488	NC_013205	GGC	2	6	122240	122245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
2489	NC_013205	TG	3	6	122295	122300	0 %	50 %	50 %	0 %	258510122
2490	NC_013205	CGT	2	6	122332	122337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510122
2491	NC_013205	CGC	2	6	122415	122420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510122
2492	NC_013205	CTT	2	6	122470	122475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510122
2493	NC_013205	GCG	2	6	122494	122499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
2494	NC_013205	GCG	2	6	122955	122960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510123
2495	NC_013205	TC	3	6	123031	123036	0 %	50 %	0 %	50 %	258510123
2496	NC_013205	GAA	2	6	123095	123100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510123
2497	NC_013205	GTC	2	6	123200	123205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2498	NC_013205	GGCG	2	8	123214	123221	0 %	0 %	75 %	25 %	258510123
2499	NC_013205	TCGT	2	8	123248	123255	0 %	50 %	25 %	25 %	258510123
2500	NC_013205	CG	3	6	123256	123261	0 %	0 %	50 %	50 %	258510123

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